AdobeのFAQにこんなものが掲載されています。

SWFコンテンツ検索に関するFAQ

引用するにはちょっと長いので詳しい内容は上記のリンクからご覧ください。

今までFLASHサイトは検索に弱いので検索を重視する場合は避けた方が良いと言われていましたが、これからはそうでもなくなるようですね。

じゃあどのような仕組みで検索エンジンにインデックスされるか？というのは全くわかりませんので、今後調べていこうと思います。